2024年5月27日Nature

标题： 尼安德特人与人类的生育是最近发生的，而且时间很短

副标题：对几十个古代基因组的分析表明，这两个物种之间的亲密接触发生在一个狭窄的时间窗口内

附图：尼安德特人(重建图，右，化石)和智人大约在47000年前开始共同生育子女

主要内容：

 大约6万年前，欧亚大陆西部的尼安德特人有了奇怪的新邻居:一波智人移民走出非洲，走向未来的全球统治。现在，一项对数百个古代和现代基因组的研究已经确定了这两个物种开始配对的时间，并发现基因混合只持续了很短的时间，至少在进化规模上是这样。

 高分辨率分析还允许作者追踪某些尼安德特人DNA序列何时出现在智人基因组中，并确定它们是否被保留下来。研究结果于本月早些时候发表在预印本服务器bioRxiv上。它们还没有经过同行评审。

 ——基因遗产

 很多人类和尼安德特人(尼安德特人)之间的关系一定是友好的:几乎每一个非非洲血统的活着的个体都携带着两个物种之间过去配对的遗传残余。先前的估计表明，这种混合发生在5万到6万年前的很长一段时间内，但这种“基因流动”的实际时间及其长期后果仍然知之甚少。

 早期的研究试图通过比较现代人的基因组和少量尼安德特人的基因组来了解这段历史。但这种方法使研究人员很难确定尼安德特人序列在现代基因组中的开始和结束位置。

 为了应对这一挑战，德国莱比锡马克斯·普朗克进化人类学研究所的进化遗传学家Leonardo Iasi和他的同事分析了生活在2200年至45000年前的58个人，并将他们的DNA与231个不同祖先的现代人的DNA进行了比较。全非洲血统的人没有携带大量的尼安德特人DNA，因为他们的祖先在尼安德特人活着的时候并没有离开非洲大陆。

 这种大规模的、跨越数千年的比较使得监测尼安德特人衍生序列进入现代人类基因组的“渗入”变得更加直接。结果表明，现代样本中尼安德特人的遗传贡献可以追溯到大约47000年前开始的一次基因流动“脉冲”——比最初预测的要晚——跨越了大约6800年，大约在尼安德特人濒临灭绝的同一时间结束。近7000年可能看起来很长，但从进化的时间尺度来看，这是非常短的。

 ——尼安德特人的沙漠

 值得注意的是，许多尼安德特人的基因组贡献随后以惊人的速度从智人基因组中移除。现代人类基因组包含了大量的“沙漠”，这些沙漠已经完全清除了尼安德特人的残余——但是作者甚至在人类与尼安德特人互动的最新阶段的古代基因组中发现了这些沙漠。根据罗得岛州普罗维登斯布朗大学的进化生物学家Emilia Huerta-Sanchez的说法，这表明许多尼安德特人的序列可能对人类有害，因此被积极而迅速地选择。

 Huerta-Sanchez说，这项工作填补了古代人类历史上的重要空白。她说:“这项研究的优势之一是，通过整合古人类基因组，他们更多地了解了进化力量是如何塑造尼安德特人在人类种群中的变异的。”

但其他差距依然存在。例如，来自某些地理区域(包括大洋洲和东亚)的祖先人类基因组数据比来自欧亚大陆西部的要少得多。东亚尤其令人感兴趣，因为该地区的现代人保留了特别高水平的尼安德特人DNA——大约比尼安德特人多20%。

 作者拒绝就本文接受《自然》杂志的采访。

原文链接：https://doi.org/10.1038/d41586-024-01452-3